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完善血友病的基因诊断体系.ppt

完善血友病的基因诊断体系.ppt
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完善血友病的基因诊断体系.ppt

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  完善血友病的基因诊断体系

  xx医院临床输血科

  xxx

  2张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 2

  FVIII (Xq28)

  FIX (Xq27)

  q

  p

  染色体 X

  血友病A、B

  3张

  标题: 血友病

  其他占位符: 替代治疗 疾病传播,费用昂贵 基因治疗没有突破 携带者及产前检查杜绝患儿出生、根治疾病

  其他占位符: 1

  其他占位符: 3

  4张

  标题: 血友病A为例说明 基因诊断的临床应用

  其他占位符: 1

  其他占位符: 4

  5张

  标题: 血友病携带者和产前诊断流程

  其他占位符:

  其他占位符: 1

  其他占位符: 5

  PCR扩增

  外周血DNA抽提(携带者)

  直接核酸测序

  间接联锁分析

  明确诊断

  长链PCR检测内含子1,22倒位

  血友病A ①、 ② 、③

  羊水DNA抽提(胎儿)

  ①

  ③

  ②

  6张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 6

  FVIII (Xq28)

  FIX (Xq27)

  q

  p

  X染色体

  血友病A、B

  7张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 7

  内含子22倒位

  8张

  标题: 结果(1)

  其他占位符: 1

  其他占位符: 8

  内含子22 倒位检测结果

  9张

  标题: 内含子1倒位机制

  其他占位符: 1

  其他占位符: 9

  10张

  标题: 内含子1倒位检测方法

  其他占位符: 1

  其他占位符: 10

  (Gp:) 2Kb

  (Gp:) 1.5Kb

  (Gp:) 2Kb

  (Gp:) 1.5Kb

  11张

  标题: 间接基因诊断

  其他占位符: 1

  其他占位符: 11

  血友病A

  12张

  其他占位符: 第一代标志 (参照国外) F8基因内的BclⅠRFLP F8基因内两个STR位点 F8基因外的St14 VNTR

  其他占位符: 1

  其他占位符: 12

  13张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 13

  家系15 Bcl I RFLP位点多态性连锁分析

  14张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 14

  家系13 st14位点VNTR多态的基因连锁分析

  15张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 15

  内含子13中STR多态位点用于家系12基因连锁分析

  147/

  147/147

  145/147

  149/

  147/149

  147/149

  145/147

  147/

  16张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 16

  国外:4个位点 2个STR (CA13、CA22),2个SNPs (BcI I、Hind Ⅲ) 诊断率约为80%(Hemophilia. Chapman & Hall, London , 63-74) 中国人:用上述4个位点 信息量仅为27%(Clin Chem Lab Med 2001;39(12):1204-1208 )

  间接诊断——血友病A新位点的探索

  17张

  标题: 第二代标志(自主开发)

  其他占位符: 6个与F8 紧密连锁的STR位点: DXS15、DXS9901、G6PD、DXS1073和DXS1108 距F8 1.5Mb内 1个F8 内的STR位点(F8Civs13) 性别位点为牙釉蛋白基因(Amelogenin gene) 终产物 X染色体102bp,Y染色体 108bp

  其他占位符: 1

  其他占位符: 17

  18张

  标题: 遗传连锁分析的多态性位点的相对位置

  其他占位符: 1

  其他占位符: 18

  (Gp:) F8

  (Gp:) F8Civs13

  (Gp:) DXS1073

  (Gp:) G6PD

  (Gp:) DXS9901

  (Gp:) DXS15

  (Gp:) DXS1108

  (Gp:) ST14

  (Gp:) CA22

  19张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 19

  所用STR位点在正常人群中检测的结果

  (Gp:) STR位点

  (Gp:) 片段长度 (bp)

  (Gp:) 不同等位基因的数目

  (Gp:) 等位基因频率(%)

  (Gp:) 期望杂合度(%)

  (Gp:) 观察杂合度(%)

  (Gp:) DXS 15

  (Gp:) 145~ 164

  (Gp:) 10

  (Gp:) 0.59~37.87

  (Gp:) 74.97

  (Gp:) 88.24 (45/51)

  (Gp:) DXS 9901

  (Gp:) 186~ 214

  (Gp:) 12

  (Gp:) 0.59~37.87

  (Gp:) 79.77

  (Gp:) 82.35 (42/51)

  (Gp:) G6PD

  (Gp:) 168~ 188

  (Gp:) 6

  (Gp:) 0.59~52.07

  (Gp:) 56.06

  (Gp:) 21.57 (11/51)

  (Gp:) DXS 1073

  (Gp:) 120~ 138

  (Gp:) 9

  (Gp:) 0.59~49.11

  (Gp:) 59.92

  (Gp:) 62.75 (32/51)

  (Gp:) DXS 1108

  (Gp:) 76~96

  (Gp:) 4

  (Gp:) 0.59~73.37

  (Gp:) 39.97

  (Gp:) 35.29 (18/51)

  (Gp:) F8Civs13

  (Gp:) 152~ 168

  (Gp:) 6

  (Gp:) 0.59~69.82

  (Gp:) 47.61

  (Gp:) 52.94 (27/51)

  20张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 20

  21张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 21

  22张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 22

  第三代标志(自主开发)

  对象:69名正常女性、31个HA家系(120名成员) 方法:人类基因组数据库中选择了位于F8基因两端0.5CM内的3个STR位点(5_226、5_147及3_486),F8基因内的1个STR位点(INTRON25)及距离F8基因2CM内的DXS8069位点,以多重荧光PCR法检测5个微卫星位点的多态性

  23张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 23

  F8

  CA22

  DXS1073

  G6PD

  DXS9901

  DXS15

  DXS1108

  ST14

  F8Civs13

  F8

  Intron25

  DXS1073

  5-226

  F8Civs13

  3-486

  5-147

  DXS8069

  24张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 24

  联合5个STR位点可对所有要求做携带者及产前诊断的血友病A家系提供遗传连锁分析结果且与F8基因直接检测结果相符

  结果与讨论

  25张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 25

  7重荧光PCR技术 降低重组发生率 未见漏诊和误诊 诊断率和准确率100%

  (Gp:) F8

  (Gp:) Intron25

  (Gp:) DXS1073

  (Gp:) 5-226

  (Gp:) F8Civs13

  (Gp:) 3-486

  (Gp:) 5-147

  (Gp:) DXS8069

  26张

  副标题: 特殊血友病A家系的基因诊断

  其他占位符: 1

  其他占位符: 26

  27张

  正文: 先证者自幼皮肤、头颅撞伤后及拔牙及手术后有出血难止,曾发生过颅内出血 BT、PT正常 APTT延长,FVIII:C 2% 输注全血或抗血友病球蛋白治疗有效 先证者已故

  其他占位符: 1

  其他占位符: 27

  家系1

  28张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 28

  家系2

  FⅧ:C 2%

  29张

  标题: 直接基因测序

  其他占位符: 结果: 携带者外周血DNA直接测序未检测出突变 原因: 据文献报道FVIII直接基因测序有1%-10%的患者查不到基因突变 ( Hum Mutat. 2002 Oct;20(4):267-74) 存在大的缺失? 内含子突变?

  其他占位符: 1

  其他占位符: 29

  30张

  标题: 携带者诊断结果

  其他占位符: 1

  其他占位符: 30

  携带者及待检者F8内含子22,1倒位均为阴性

  (Gp:) 2Kb

  (Gp:) 1.5Kb

  (Gp:) 2Kb

  (Gp:) 1.5Kb

  31张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 31

  32张

  标题: 间接诊断结果 BclI酶切图

  其他占位符: 1

  其他占位符: 32

  III-1表姐: -/- II-2舅妈: -/- II-3母亲: +/- II-4父亲: +/+ III-2待检者:+/+

  M

  33张

  标题: BclI酶切图测序图

  其他占位符: 1

  其他占位符: 33

  BclI酶切识别位点 T/GATCA 图a 待检者测序图, 含BclI酶切位点 图b 表姐测序图,不 含BclI酶切位点

  a

  b

  34张

  标题: 间接诊断结果 ca13 基因扫描

  其他占位符: 1

  其他占位符: 34

  III-1 表姐:144/144 III-2待检者:142/142 II-3母亲:142/144 II-2舅妈:140/144 II-4父亲:142/-

  35张

  标题: 间接诊断结果 ca22基因扫描

  其他占位符: 1

  其他占位符: 35

  III-1 表姐:79/79 III-2待检者:79/83 II-3母亲:83/79 II-2舅妈:79/79 II-4父亲:79/-

  36张

  标题: 血友病A携带者间接诊断结果分析

  其他占位符: 1

  其他占位符: 36

  表姐

  舅妈

  父亲

  母亲

  待检者

  综合A13、CA22及Bcl I 信息,待检者与其表姐有不同的X染色体

  舅舅

  37张

  标题: 女性血友病A的基因及产前诊断

  其他占位符: 1

  其他占位符: 37

  38张

  标题: 标本来源

  其他占位符: 先证者(II-1),女,21岁,汉族,自幼有踝关节及膝关节有自发出血,临床诊断为血友病A,冷沉淀及浓缩FVIII输注有效,因怀孕要求作基因诊断及产前诊断

  其他占位符: 1

  其他占位符: 38

  ?

  ?

  39张

  标题: 基因检测结果

  其他占位符: F8内含子22倒位 F8内含子1倒位 先证者 阳性(携带者) 阴性 胎儿 阴性 阴性 其他人 阴性 阴性 先证者F8基因所有外显子及其侧翼序列扩增测序 (-)

  其他占位符: 1

  其他占位符: 39

  40张

  标题: 遗传连锁分析

  其他占位符: 1

  其他占位符: 40

  (Gp:) 319 218 150 282 340 172 374

  (Gp:) 323 212 150 282 346 172 365

  (Gp:) 319 218 150 282 340 172 374

  (Gp:) 325 220 150 280 340 172 374

  (Gp:) 325 220 150 280 340 172 374

  (Gp:) 319 218 150 282 340 172 374

  (Gp:) 325 220 150 280 340 172 374

  (Gp:) 323 212 150 282 346 172 365

  (Gp:) 325 220 150 280 340 172 374

  (Gp:) HA患者

  (Gp:) 正常男性

  (Gp:) 胎儿

  (Gp:) 正常女性

  (Gp:) 先证者

  (Gp:) 图2 家系多态性位点遗传连锁分析图

  (Gp:) I

  (Gp:) II

  (Gp:) III

  (Gp:) 1

  (Gp:) 2

  (Gp:) 1

  (Gp:) 2

  (Gp:) 3

  (Gp:) 4

  (Gp:) 1

  (Gp:) 325 212 130 280 340 172 374

  (Gp:) 325 212 130 280 340 172 374

  41张

  标题: 发病机制

  正文: 先证者来自母系的X染色体大部分被灭活,而来自父系的X染色体保留活性 家系其他成员及胎儿为X染色体随机灭活

  其他占位符: 1

  其他占位符: 41

  42张

  标题: 发病机制

  其他占位符: 先证者一条X染色体发生了F8基因内含子22倒位,而未检测到其它F8基因相关突变 遗传连锁分析发现该女性患者的两条X染色体分别遗传自其父母,排除其为单亲二倍体 先证者的X染色体灭活呈非随机性灭活,其遗传自父亲的X染色体大部分保留了活性

  其他占位符: 1

  其他占位符: 42

  43张

  标题: 女性血友病 A(2)

  其他占位符: 1

  其他占位符: 43

  女性血友病: (FVIII:C 3.4%,FVIII:Ag 4.2% Leu1975Pro 和 3637-3638insA

  父亲: (FVIII:C 6.9%, FVIII:Ag 7.4%), Leu1975Pro mutation

  J Thrombosis and haemostasis 2006

  44张

  标题: 3637-3638insA突变是如何产生的?

  其他占位符: 母亲外周血DNA的 F8 没有检测到基因突变 母亲不同组织DNA F8基因检测也没有检测到突变,不是体细胞的嵌和体 患者3637-3638insA自发突变( de novo)

  其他占位符: 1

  其他占位符: 44

  45张

  标题: 框移突变(3637-3638insA)

  其他占位符: 1

  其他占位符: 45

  定量 RT-PCR显示: 患者的FVIII mRNA减少

  结论: 女性血友病A患者是其F8基因中来自父亲的Leu1975Pro突变和自发突变 3637-3638insA,双重杂合突变导致的

  46张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 46

  一个血友病家系,父亲为血友病A,儿子为血友病B

  同时存在HA和HB患者家系的基因诊断

  HA

  HB

  47张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 47

  FVIII (Xq28)

  FIX (Xq27)

  q

  p

  染色体 X

  血友病A、B

  +

  48张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 48

  Result of phynotype detection

  49张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 49

  基因诊断结果

  F8INV 22: 父亲 (+)其他成员(-) F8INV 1 : 所有成员(-) F9测序:儿子 mutation(32772A→T,Ser365Cys), 母亲 同位置杂合子 阿姨、外公(-) 父亲 (-)

  50张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 50

  Result of linkage analysis

  (Gp:) 399 340 208 166 313 365

  (Gp:) 399 340 208 166 313 365

  (Gp:) 399 340 208 166 313 365

  (Gp:) 399 340 208 166 313 365

  (Gp:) 389 336 210 164 313 358

  (Gp:) 395 350 212 180 313 358

  (Gp:) 395 350 212 180 313 358

  (Gp:) 395 350 212 180 313 358

  (Gp:) Ⅰ

  (Gp:) Ⅱ

  (Gp:) Ⅲ

  (Gp:) 3

  (Gp:) 4

  (Gp:) 6

  (Gp:) 7

  (Gp:) 8

  (Gp:) 9

  (Gp:) 10

  (Gp:) 7

  ?

  ?

  +:FIX基因缺陷

  +

  +

  _

  _

  51张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 51

  外周血细胞、组织细胞 外公 体细胞、生殖细胞嵌合体

  外公

  阿姨

  Peripheral blood

  buccal cavity cells

  Enqomphesis rate :14.1%

  嵌合体检测

  52张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 52

  凝血因子V和VIII联合缺陷;常染色体隐性遗传性疾病;发病率为1/100万,男女均可发病 致病基因并非F5,F8基因,而是与蛋白转运相关受体的编码基因突变导致:LMAN1(70%),MCFD2(30%) 分子发病机制研究

  F5F8D家系基因诊断

  53张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 53

  54张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 54

  F5F8D家系基因诊断(1)

  先证者1:10岁女孩,口腔粘膜反复出血 患者母亲怀孕要求做产前诊断

  55张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 55

  F5F8D家系基因诊断(2)

  先证者2:50岁女性,贫血,凝血功能不佳, 长期痔疮出血 先证者3:47岁女性,凝血功能不佳

  56张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 56

  F5F8D家系基因诊断(4)

  先证者4:50岁男性,平时无明显的凝血功能异常现象,因痔疮出血难止于术前进行凝血功能筛查

  57张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 57

  F5F8D家系实验室检测结果

  58张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 58

  F5F8D家系基因检测结果

  先证者1: LMAN1:Exon8 nt925-933insA 305frameshift 编码20个氨基酸后终止 LMAN1:Exon11 nt1387C>CT(X71661.1) 456Arg>Stop

  母亲

  父亲

  产前诊断:胎儿为女性,且携带了来自父亲的突变

  59张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 59

  先证者2、3: MCFD2:Exon4 nt501T>C,导致第136位氨基酸错义突变,136 Ile>Thr

  F5F8D家系基因检测结果

  60张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 60

  F5F8D家系基因检测结果

  先证者4:LMAN1:Exon5 nt636C>T ,导致202R>Stop

  先证者4之子(杂合子):LMAN1:Exon5 nt636C>CT

  61张

  副标题: 间接诊断中的基因重组

  其他占位符: 1

  其他占位符: 61

  62张

  标题: HA家系情况

  其他占位符: 先证者II-3为重型血友病A患者,F8C<1.0% II-5要求作携带者诊断

  其他占位符: 1

  其他占位符: 62

  ?

  63张

  标题: HA家系遗传连锁分析的结果

  其他占位符: 1

  其他占位符: 63

  5

  A 154 203 203 124 156 80 86

  C 154 203 203 124 156 84 96

  B 154 195 195 128 156 80 86

  Ⅰ

  Ⅱ

  1

  2

  3

  B 154 195 195 128 156 80 86

  C 154 203 203

  128 156 80 86

  A 154 203 203 124 156 80 86

  ?

  (Gp:) F8

  (Gp:) F8

  (Gp:) F8

  (Gp:) F8

  64张

  标题: HA家系检测结果

  其他占位符: 22倒位:均为阴性 1倒位:先证者(II-3)为阳性,女性(II-5)为携带者

  其他占位符: 1

  其他占位符: 64

  (Gp:) 2Kb

  (Gp:) 1.5Kb

  (Gp:) 2Kb

  (Gp:) 1.5Kb

  65张

  标题: HA家系诊断结果

  其他占位符: 内含子1倒位是该家系HA发生的致病机制,II-5为内含子1倒位携带者 遗传连锁分析发现II-5在ST14,DXS15,DXS9901,G6PD与DXS1073,F8Civs13,CA22,DXS1108间发生染色体的同源重组

  其他占位符: 1

  其他占位符: 65

  66张

  标题: 结 论

  其他占位符: 在应用间接诊断进行HA家系携带者及产前诊断时,不能仅使用单一的位点进行诊断,必须联合应用多个与F8相关的位点来进行遗传连锁分析,尤其是F8基因内的多态性位点

  其他占位符: 1

  其他占位符: 66

  67张

  标题: 2009血友病基因诊断

  其他占位符: 1

  其他占位符: 67

  (Gp:) 瑞杰

  68张

  其他占位符: 1

  其他占位符: 68

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