完善血友病的基因诊断体系.ppt
1张
其他占位符: 1
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完善血友病的基因诊断体系
xx医院临床输血科
xxx
2张
其他占位符: 1
其他占位符: 2
FVIII (Xq28)
FIX (Xq27)
q
p
染色体 X
血友病A、B
3张
标题: 血友病
其他占位符: 替代治疗 疾病传播,费用昂贵 基因治疗没有突破 携带者及产前检查杜绝患儿出生、根治疾病
其他占位符: 1
其他占位符: 3
4张
标题: 血友病A为例说明基因诊断的临床应用
其他占位符: 1
其他占位符: 4
5张
标题: 血友病携带者和产前诊断流程
其他占位符:
其他占位符: 1
其他占位符: 5
PCR扩增
外周血DNA抽提(携带者)
直接核酸测序
间接联锁分析
明确诊断
长链PCR检测内含子1,22倒位
血友病A ①、 ② 、③
羊水DNA抽提(胎儿)
①
③
②
6张
其他占位符: 1
其他占位符: 6
FVIII (Xq28)
FIX (Xq27)
q
p
X染色体
血友病A、B
7张
其他占位符: 1
其他占位符: 7
内含子22倒位
8张
标题: 结果(1)
其他占位符: 1
其他占位符: 8
内含子22 倒位检测结果
9张
标题: 内含子1倒位机制
其他占位符: 1
其他占位符: 9
10张
标题: 内含子1倒位检测方法
其他占位符: 1
其他占位符: 10
(Gp:) 2Kb
(Gp:) 1.5Kb
(Gp:) 2Kb
(Gp:) 1.5Kb
11张
标题: 间接基因诊断
其他占位符: 1
其他占位符: 11
血友病A
12张
其他占位符: 第一代标志 (参照国外) F8基因内的BclⅠRFLP F8基因内两个STR位点 F8基因外的St14 VNTR
其他占位符: 1
其他占位符: 12
13张
其他占位符: 1
其他占位符: 13
家系15 Bcl I RFLP位点多态性连锁分析
14张
其他占位符: 1
其他占位符: 14
家系13 st14位点VNTR多态的基因连锁分析
15张
其他占位符: 1
其他占位符: 15
内含子13中STR多态位点用于家系12基因连锁分析
147/
147/147
145/147
149/
147/149
147/149
145/147
147/
16张
其他占位符: 1
其他占位符: 16
国外:4个位点 2个STR (CA13、CA22),2个SNPs (BcI I、Hind Ⅲ) 诊断率约为80%(Hemophilia. Chapman & Hall, London , 63-74) 中国人:用上述4个位点 信息量仅为27%(Clin Chem Lab Med 2001;39(12):1204-1208 )
间接诊断——血友病A新位点的探索
17张
标题: 第二代标志(自主开发)
其他占位符: 6个与F8 紧密连锁的STR位点: DXS15、DXS9901、G6PD、DXS1073和DXS1108 距F8 1.5Mb内 1个F8 内的STR位点(F8Civs13) 性别位点为牙釉蛋白基因(Amelogenin gene) 终产物 X染色体102bp,Y染色体 108bp
其他占位符: 1
其他占位符: 17
18张
标题: 遗传连锁分析的多态性位点的相对位置
其他占位符: 1
其他占位符: 18
(Gp:) F8
(Gp:) F8Civs13
(Gp:) DXS1073
(Gp:) G6PD
(Gp:) DXS9901
(Gp:) DXS15
(Gp:) DXS1108
(Gp:) ST14
(Gp:) CA22
19张
其他占位符: 1
其他占位符: 19
所用STR位点在正常人群中检测的结果
(Gp:) STR位点
(Gp:) 片段长度 (bp)
(Gp:) 不同等位基因的数目
(Gp:) 等位基因频率(%)
(Gp:) 期望杂合度(%)
(Gp:) 观察杂合度(%)
(Gp:) DXS 15
(Gp:) 145~ 164
(Gp:) 10
(Gp:) 0.59~37.87
(Gp:) 74.97
(Gp:) 88.24 (45/51)
(Gp:) DXS 9901
(Gp:) 186~ 214
(Gp:) 12
(Gp:) 0.59~37.87
(Gp:) 79.77
(Gp:) 82.35 (42/51)
(Gp:) G6PD
(Gp:) 168~ 188
(Gp:) 6
(Gp:) 0.59~52.07
(Gp:) 56.06
(Gp:) 21.57 (11/51)
(Gp:) DXS 1073
(Gp:) 120~ 138
(Gp:) 9
(Gp:) 0.59~49.11
(Gp:) 59.92
(Gp:) 62.75 (32/51)
(Gp:) DXS 1108
(Gp:) 76~96
(Gp:) 4
(Gp:) 0.59~73.37
(Gp:) 39.97
(Gp:) 35.29 (18/51)
(Gp:) F8Civs13
(Gp:) 152~ 168
(Gp:) 6
(Gp:) 0.59~69.82
(Gp:) 47.61
(Gp:) 52.94 (27/51)
20张
其他占位符: 1
其他占位符: 20
21张
其他占位符: 1
其他占位符: 21
22张
其他占位符: 1
其他占位符: 22
第三代标志(自主开发)
对象:69名正常女性、31个HA家系(120名成员) 方法:人类基因组数据库中选择了位于F8基因两端0.5CM内的3个STR位点(5_226、5_147及3_486),F8基因内的1个STR位点(INTRON25)及距离F8基因2CM内的DXS8069位点,以多重荧光PCR法检测5个微卫星位点的多态性
23张
其他占位符: 1
其他占位符: 23
F8
CA22
DXS1073
G6PD
DXS9901
DXS15
DXS1108
ST14
F8Civs13
F8
Intron25
DXS1073
5-226
F8Civs13
3-486
5-147
DXS8069
24张
其他占位符: 1
其他占位符: 24
联合5个STR位点可对所有要求做携带者及产前诊断的血友病A家系提供遗传连锁分析结果且与F8基因直接检测结果相符
结果与讨论
25张
其他占位符: 1
其他占位符: 25
7重荧光PCR技术 降低重组发生率 未见漏诊和误诊 诊断率和准确率100%
(Gp:) F8
(Gp:) Intron25
(Gp:) DXS1073
(Gp:) 5-226
(Gp:) F8Civs13
(Gp:) 3-486
(Gp:) 5-147
(Gp:) DXS8069
26张
副标题: 特殊血友病A家系的基因诊断
其他占位符: 1
其他占位符: 26
27张
正文: 先证者自幼皮肤、头颅撞伤后及拔牙及手术后有出血难止,曾发生过颅内出血 BT、PT正常 APTT延长,FVIII:C 2% 输注全血或抗血友病球蛋白治疗有效 先证者已故
其他占位符: 1
其他占位符: 27
家系1
28张
其他占位符: 1
其他占位符: 28
家系2
FⅧ:C 2%
29张
标题: 直接基因测序
其他占位符: 结果: 携带者外周血DNA直接测序未检测出突变 原因: 据文献报道FVIII直接基因测序有1%-10%的患者查不到基因突变 ( Hum Mutat. 2002 Oct;20(4):267-74) 存在大的缺失? 内含子突变?
其他占位符: 1
其他占位符: 29
30张
标题: 携带者诊断结果
其他占位符: 1
其他占位符: 30
携带者及待检者F8内含子22,1倒位均为阴性
(Gp:) 2Kb
(Gp:) 1.5Kb
(Gp:) 2Kb
(Gp:) 1.5Kb
31张
其他占位符: 1
其他占位符: 31
32张
标题: 间接诊断结果BclI酶切图
其他占位符: 1
其他占位符: 32
III-1表姐: -/- II-2舅妈: -/- II-3母亲: +/- II-4父亲: +/+ III-2待检者:+/+
M
33张
标题: BclI酶切图测序图
其他占位符: 1
其他占位符: 33
BclI酶切识别位点 T/GATCA 图a 待检者测序图, 含BclI酶切位点 图b 表姐测序图,不 含BclI酶切位点
a
b
34张
标题: 间接诊断结果ca13 基因扫描
其他占位符: 1
其他占位符: 34
III-1 表姐:144/144 III-2待检者:142/142 II-3母亲:142/144 II-2舅妈:140/144 II-4父亲:142/-
35张
标题: 间接诊断结果ca22基因扫描
其他占位符: 1
其他占位符: 35
III-1 表姐:79/79 III-2待检者:79/83 II-3母亲:83/79 II-2舅妈:79/79 II-4父亲:79/-
36张
标题: 血友病A携带者间接诊断结果分析
其他占位符: 1
其他占位符: 36
表姐
舅妈
父亲
母亲
待检者
综合A13、CA22及Bcl I 信息,待检者与其表姐有不同的X染色体
舅舅
37张
标题: 女性血友病A的基因及产前诊断
其他占位符: 1
其他占位符: 37
38张
标题: 标本来源
其他占位符: 先证者(II-1),女,21岁,汉族,自幼有踝关节及膝关节有自发出血,临床诊断为血友病A,冷沉淀及浓缩FVIII输注有效,因怀孕要求作基因诊断及产前诊断
其他占位符: 1
其他占位符: 38
?
?
39张
标题: 基因检测结果
其他占位符: F8内含子22倒位 F8内含子1倒位 先证者 阳性(携带者) 阴性 胎儿 阴性 阴性 其他人 阴性 阴性 先证者F8基因所有外显子及其侧翼序列扩增测序 (-)
其他占位符: 1
其他占位符: 39
40张
标题: 遗传连锁分析
其他占位符: 1
其他占位符: 40
(Gp:) 319 218 150 282 340 172 374
(Gp:) 323 212 150 282 346 172 365
(Gp:) 319 218 150 282 340 172 374
(Gp:) 325 220 150 280 340 172 374
(Gp:) 325 220 150 280 340 172 374
(Gp:) 319 218 150 282 340 172 374
(Gp:) 325 220 150 280 340 172 374
(Gp:) 323 212 150 282 346 172 365
(Gp:) 325 220 150 280 340 172 374
(Gp:) HA患者
(Gp:) 正常男性
(Gp:) 胎儿
(Gp:) 正常女性
(Gp:) 先证者
(Gp:) 图2 家系多态性位点遗传连锁分析图
(Gp:) I
(Gp:) II
(Gp:) III
(Gp:) 1
(Gp:) 2
(Gp:) 1
(Gp:) 2
(Gp:) 3
(Gp:) 4
(Gp:) 1
(Gp:) 325 212 130 280 340 172 374
(Gp:) 325 212 130 280 340 172 374
41张
标题: 发病机制
正文: 先证者来自母系的X染色体大部分被灭活,而来自父系的X染色体保留活性 家系其他成员及胎儿为X染色体随机灭活
其他占位符: 1
其他占位符: 41
42张
标题: 发病机制
其他占位符: 先证者一条X染色体发生了F8基因内含子22倒位,而未检测到其它F8基因相关突变 遗传连锁分析发现该女性患者的两条X染色体分别遗传自其父母,排除其为单亲二倍体 先证者的X染色体灭活呈非随机性灭活,其遗传自父亲的X染色体大部分保留了活性
其他占位符: 1
其他占位符: 42
43张
标题: 女性血友病 A(2)
其他占位符: 1
其他占位符: 43
女性血友病: (FVIII:C 3.4%,FVIII:Ag 4.2% Leu1975Pro 和 3637-3638insA
父亲: (FVIII:C 6.9%, FVIII:Ag 7.4%), Leu1975Pro mutation
J Thrombosis and haemostasis 2006
44张
标题: 3637-3638insA突变是如何产生的?
其他占位符: 母亲外周血DNA的 F8 没有检测到基因突变 母亲不同组织DNA F8基因检测也没有检测到突变,不是体细胞的嵌和体 患者3637-3638insA自发突变( de novo)
其他占位符: 1
其他占位符: 44
45张
标题: 框移突变(3637-3638insA)
其他占位符: 1
其他占位符: 45
定量 RT-PCR显示: 患者的FVIII mRNA减少
结论: 女性血友病A患者是其F8基因中来自父亲的Leu1975Pro突变和自发突变 3637-3638insA,双重杂合突变导致的
46张
其他占位符: 1
其他占位符: 46
一个血友病家系,父亲为血友病A,儿子为血友病B
同时存在HA和HB患者家系的基因诊断
HA
HB
47张
其他占位符: 1
其他占位符: 47
FVIII (Xq28)
FIX (Xq27)
q
p
染色体 X
血友病A、B
+
48张
其他占位符: 1
其他占位符: 48
Result of phynotype detection
49张
其他占位符: 1
其他占位符: 49
基因诊断结果
F8INV 22: 父亲 (+)其他成员(-) F8INV 1 : 所有成员(-) F9测序:儿子 mutation(32772A→T,Ser365Cys), 母亲 同位置杂合子 阿姨、外公(-) 父亲 (-)
50张
其他占位符: 1
其他占位符: 50
Result of linkage analysis
(Gp:) 399 340 208 166 313 365
(Gp:) 399 340 208 166 313 365
(Gp:) 399 340 208 166 313 365
(Gp:) 399 340 208 166 313 365
(Gp:) 389 336 210 164 313 358
(Gp:) 395 350 212 180 313 358
(Gp:) 395 350 212 180 313 358
(Gp:) 395 350 212 180 313 358
(Gp:) Ⅰ
(Gp:) Ⅱ
(Gp:) Ⅲ
(Gp:) 3
(Gp:) 4
(Gp:) 6
(Gp:) 7
(Gp:) 8
(Gp:) 9
(Gp:) 10
(Gp:) 7
?
?
+:FIX基因缺陷
+
+
_
_
51张
其他占位符: 1
其他占位符: 51
外周血细胞、组织细胞 外公 体细胞、生殖细胞嵌合体
外公
阿姨
Peripheral blood
buccal cavity cells
Enqomphesis rate :14.1%
嵌合体检测
52张
其他占位符: 1
其他占位符: 52
凝血因子V和VIII联合缺陷;常染色体隐性遗传性疾病;发病率为1/100万,男女均可发病 致病基因并非F5,F8基因,而是与蛋白转运相关受体的编码基因突变导致:LMAN1(70%),MCFD2(30%) 分子发病机制研究
F5F8D家系基因诊断
53张
其他占位符: 1
其他占位符: 53
54张
其他占位符: 1
其他占位符: 54
F5F8D家系基因诊断(1)
先证者1:10岁女孩,口腔粘膜反复出血 患者母亲怀孕要求做产前诊断
55张
其他占位符: 1
其他占位符: 55
F5F8D家系基因诊断(2)
先证者2:50岁女性,贫血,凝血功能不佳, 长期痔疮出血 先证者3:47岁女性,凝血功能不佳
56张
其他占位符: 1
其他占位符: 56
F5F8D家系基因诊断(4)
先证者4:50岁男性,平时无明显的凝血功能异常现象,因痔疮出血难止于术前进行凝血功能筛查
57张
其他占位符: 1
其他占位符: 57
F5F8D家系实验室检测结果
58张
其他占位符: 1
其他占位符: 58
F5F8D家系基因检测结果
先证者1: LMAN1:Exon8 nt925-933insA 305frameshift 编码20个氨基酸后终止 LMAN1:Exon11 nt1387C>CT(X71661.1) 456Arg>Stop
母亲
父亲
产前诊断:胎儿为女性,且携带了来自父亲的突变
59张
其他占位符: 1
其他占位符: 59
先证者2、3: MCFD2:Exon4 nt501T>C,导致第136位氨基酸错义突变,136 Ile>Thr
F5F8D家系基因检测结果
60张
其他占位符: 1
其他占位符: 60
F5F8D家系基因检测结果
先证者4:LMAN1:Exon5 nt636C>T ,导致202R>Stop
先证者4之子(杂合子):LMAN1:Exon5 nt636C>CT
61张
副标题: 间接诊断中的基因重组
其他占位符: 1
其他占位符: 61
62张
标题: HA家系情况
其他占位符: 先证者II-3为重型血友病A患者,F8C<1.0% II-5要求作携带者诊断
其他占位符: 1
其他占位符: 62
?
63张
标题: HA家系遗传连锁分析的结果
其他占位符: 1
其他占位符: 63
5
A 154 203 203 124 156 80 86
C 154 203 203 124 156 84 96
B 154 195 195 128 156 80 86
Ⅰ
Ⅱ
1
2
3
B 154 195 195 128 156 80 86
C 154 203 203
128 156 80 86
A 154 203 203 124 156 80 86
?
(Gp:) F8
(Gp:) F8
(Gp:) F8
(Gp:) F8
64张
标题: HA家系检测结果
其他占位符: 22倒位:均为阴性 1倒位:先证者(II-3)为阳性,女性(II-5)为携带者
其他占位符: 1
其他占位符: 64
(Gp:) 2Kb
(Gp:) 1.5Kb
(Gp:) 2Kb
(Gp:) 1.5Kb
65张
标题: HA家系诊断结果
其他占位符: 内含子1倒位是该家系HA发生的致病机制,II-5为内含子1倒位携带者 遗传连锁分析发现II-5在ST14,DXS15,DXS9901,G6PD与DXS1073,F8Civs13,CA22,DXS1108间发生染色体的同源重组
其他占位符: 1
其他占位符: 65
66张
标题: 结 论
其他占位符: 在应用间接诊断进行HA家系携带者及产前诊断时,不能仅使用单一的位点进行诊断,必须联合应用多个与F8相关的位点来进行遗传连锁分析,尤其是F8基因内的多态性位点
其他占位符: 1
其他占位符: 66
67张
标题: 2009血友病基因诊断
其他占位符: 1
其他占位符: 67
(Gp:) 瑞杰
68张
其他占位符: 1
其他占位符: 68
Thank you
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