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基因重组和基因工程.ppt

基因重组和基因工程.ppt
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基因重组和基因工程.ppt

  1张

  副标题: 基因重组和基因工程

  2张

  标题: 第 一 节 基因重组

  3张

  基因重组

  接合作用 (conjugation)

  转化作用 (transformation)

  转导作用 (transduction)

  转 座 (transposition)

  同源重组 (homologous recombination)

  位点特异的重组(site-specific recombination)

  4张

  发生在同源序列间的重组称为同源重组(homologous recombination),又称基本重组。是最基本的DNA重组方式,通过链的断裂和再连接,在两个DNA分子同源序列间进行单链或双链片段的交换。

  以E.coli的同源重组为例,了解同源重组机制的Holliday模型。

  一、同源重组

  5张

  标题: Holliday模型中,同源重组主要4个关键步骤

  正文: ①两个同源染色体DNA排列整齐 ②一个DNA的一条链断裂、并与另一个DNA对应的链连接,形成Holliday中间体 ③通过分支移动产生异源双链DNA ④Holliday中间体切开并修复,形成两个双链重组体DNA,分别为:

  (Gp:) 片段重组体(patch recombinant)

  (Gp:) 拼接重组体(splice recombinant)

  6张

  片段重组体 (见模型图右边产物): 切开的链与原来断裂的是同一条链,重组体含有一段异源双链区,其两侧来自同一亲本DNA。

  拼接重组体(见模型图左边产物): 切开的链并非原来断裂的链,重组体异源双链区的两侧来自不同亲本DNA。

  7张

  (Gp:) 内切酶 (recBCD)

  (Gp:) DNA侵扰 (recA)

  (Gp:) 分支迁移 (recA)

  (Gp:) 内切酶 (recBCD)

  (Gp:) DNA 连接酶

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  Holiday中间体

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  8张

  (Gp:) Holiday中间体

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 5′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 3′

  (Gp:) 内切酶 (ruvC)

  (Gp:) 内切酶 (ruvC)

  (Gp:) DNA 连接酶

  (Gp:) DNA 连接酶

  片段重组体

  拼接重组体

  9张

  二、细菌的基因转移与重组

  (一)接合作用

  当细胞与细胞、或细菌通过菌毛相互接触时,质粒DNA从一个细胞(细菌)转移至另一细胞(细菌)的DNA转移称为接合作用(conjugation)。

  10张

  可接合质粒如 F 因子(F factor)

  质粒 —— 细菌染色体外的小型环状双链DNA分子

  11张

  (二)转化作用

  通过自动获取或人为地供给外源DNA,使细胞或培养的受体细胞获得新的遗传表型,称为转化作用 (transformation)。

  12张

  例:溶菌时,裂解的DNA片段被另一细菌摄取。

  13张

  14张

  (三)转导作用

  当病毒从被感染的(供体)细胞释放出来、再次感染另一(供体)细胞时,发生在供体细胞与受体细胞之间的DNA转移及基因重组即为转导作用(transduction)。

  15张

  λ噬菌体的生活史

  溶菌生长途径 (lysis pathway) 溶源菌生长途径 (lysogenic pathway)

  例

  16张

  三、位点特异重组 位点特异重组(site-specific recombination) 是由整合酶催化,在两个DNA序列的特异位点间发生的整合。

  例 (一)λ噬菌体DNA的整合 λ噬菌体的整合酶识别噬菌体和宿主染色体的特异靶位点发生选择性整合;反转录病毒整合酶可特异地识别、整合反转录病毒cDNA的长末端重复序列(long terminal repeat, LTR)。

  17张

  λ-噬菌体位点特异性重组

  18张

  例(二)细菌的特异位点重组

  沙门氏菌H片段倒位决定鞭毛相转变

  19张

  hix为反向重复序列,它们之间的H片段可在Hin控制下进行特异位点重组(倒位)。H片段上有两个启动子P,其一驱动hin基因表达,另一正向时驱动H2和rH1基因表达,反向(倒位)时H2和rH1不表达。rH1为H1的阻遏蛋白基因。

  20张

  (Gp:) H2鞭毛素

  (Gp:) 阻遏蛋白

  (Gp:) Hin重组酶

  (Gp:) 转位片段

  (Gp:) hin

  (Gp:) H2

  (Gp:) I

  (Gp:) H1

  (Gp:) H1鞭毛素

  (Gp:) hin

  (Gp:) H2

  (Gp:) I

  (Gp:) DNA

  (Gp:) 启动序列

  (Gp:) H1

  (Gp:) 启动序列

  沙门氏菌H片段倒位决定鞭毛相转变

  21张

  例(三)免疫球蛋白基因的重排

  免疫球蛋白(Ig),由两条轻链(L链)和两条重链(H链)组成,分别由三个独立的基因族编码,其中两个编码轻链(?和?),一个编码重链。

  轻链的基因片段:

  重链的基因片段:

  (Gp:) L V J C

  (Gp:) L V D J C

  22张

  重链(IgH)基因的V-D-J重排和轻链(IgL)基因的V-J重排均发生在特异位点上。在V片段的下游,J片段的上游以及D片段的两侧均存在保守的重组信号序列(recombination signal sequence, RSS)。此重排的重组酶基因rag (recombination activating gene)共有两个,分别产生蛋白质RAG1和RAG2。

  (Gp:) CACAGTG(12/23)ACAAAAACC

  (Gp:) GTGTCCAC TGTTTTTGG

  (Gp:) 重组信号序列

  (Gp:) 基因片段

  23张

  免疫球蛋白基因重排过程

  24张

  四、转座重组

  由插入序列和转座子介导的基因移位或重排称为转座(transposition)。

  25张

  插入序列(insertion sequences, IS)组成: 二个分离的反向重复(inverted repeats, IR)序列 特有的正向重复序列 一个转座酶(transposase)编码基因

  (Gp:) IR

  (Gp:) Transposase Gene

  (Gp:) IR

  发生形式: 保守性转座(conservative transposition) 复制性转座(duplicative transposition)

  (一)插入序列转座

  26张

  插入序列的复制性转座

  27张

  转座子(transposons) ——可从一个染色体位点转移到另一位点的分散重复序列。 转座子组成:反向重复序列 转座酶编码基因 抗生素抗性等有用的基因

  (Gp:) IR

  (Gp:) IR

  (Gp:) Transposase Gene

  (Gp:) 有用基因

  (二)转座子转座

  28张

  29张

  由转座子介导的转座

  30张

  标题: 第 二 节 基因工程

  31张

  基因工程的发展史

  年 G.J.Mendel的豌豆杂交试验 1944年 O.T.Avery的肺炎球菌转化实验 1973年 美国斯坦福大学的科学家构建第一个重组DNA分子 1977年 美国南旧金山由博耶和斯旺森建立世界上第一家遗传工程公司,专门应用重组DNA技术制造医学上重要的药物。 1980年 开始建造第一家应用重组DNA技术生产胰岛素的工厂 1997年 英国罗林研究所成功的克隆了多莉

  32张

  33张

  34张

  正文: 相关概念 DNA克隆 工具酶 目的基因 基因载体 基本原理 基因工程与医学的关系

  本节主要内容

  35张

  一、基因工程技术相关概念

  克隆(clone) 来自同一始祖的相同副本或拷贝的集合。

  获取同一拷贝的过程称为克隆化(cloning),即无性繁殖。

  (一) DNA克隆

  36张

  技术水平:分子克隆(molecular clone) 即DNA 克隆 细胞克隆 个体克隆(动物或植物)

  37张

  DNA克隆 应用酶学的方法,在体外将各种来源的遗传物质(同源的或异源的、原核的或真核的、天然的或人工的DNA)与载体DNA接合成一具有自我复制能力的DNA分子——复制子(replicon),继而通过转化或转染宿主细胞,筛选出含有目的基因的转化子细胞,再进行扩增提取获得大量同一DNA分子,也称基因克隆或重组DNA (recombinant DNA) 。

  38张

  生物技术工程: 基因工程、蛋白质工程、酶工程、细胞工程等

  目的 ① 分离获得某一感兴趣的基因或DNA ② 获得感兴趣基因的表达产物(蛋白质)

  基因工程(genetic engineering) —— 实现基因克隆所用的方法及相关的工作称基因工程,

  39张

  标题: (二)工具酶

  正文: 限制性核酸内切酶 DNA聚合酶Ⅰ 逆转录酶 T4DNA连接酶 碱性磷酸酶 末端转移酶 Taq DNA聚合酶

  40张

  基因工程中常用的工具酶

  41张

  限制性核酸内切酶

  定义 限制性核酸内切酶(restriction endonuclease, RE)是识别DNA的特异序列, 并在识别位点或其周围切割双链DNA的一类内切酶。

  (Gp:) GGATCC CCTAGG

  (Gp:) G CCTAG

  (Gp:) GATCC G

  +

  Bam HⅠ

  42张

  作用 与甲基化酶共同构成细菌的限制修饰系统,限制外源DNA, 保护自身DNA。

  分类 Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ (基因工程技术中常用Ⅱ型)

  43张

  第一个字母取自产生该酶的细菌属名,用大写; 第二、第三个字母是该细菌的种名,用小写; 第四个字母代表株; 用罗马数字表示发现的先后次序。

  命名

  Hin dⅢ

  (Gp:) 属 系 株 序

  Haemophilus influenzae d株 流感嗜血杆菌d株的第三种酶

  44张

  Ⅱ类酶识别序列特点—— 回文结构(palindrome)

  切口 :平端切口、粘端切口

  (Gp:) GGATCC CCTAGG

  45张

  Bam HⅠ

  (Gp:) GTC CAG

  (Gp:) G CCTAG

  (Gp:) GATCC G

  +

  (Gp:) GGATCC CCTAGG

  HindⅡ

  (Gp:) GTCGAC CAGCTG

  (Gp:) GAC CTG

  +

  平端切口

  粘端切口

  46张

  同功异源酶 来源不同的限制酶,但能识别和切割同一位点,这些酶称同功异源酶。

  (Gp:) GGATCC CCTAGG

  (Gp:) G CCTAG

  (Gp:) GATCC G

  +

  Bam HⅠ

  (Gp:) GGATCC CCTAGG

  (Gp:) G CCTAG

  (Gp:) GATCC G

  +

  BstⅠ

  47张

  同尾酶 有些限制性内切酶虽然识别序列不完全相同,但切割DNA后,产生相同的粘性末端,称为同尾酶。这两个相同的粘性末端称为配伍未端(compatible end)。

  Bam HⅠ

  Bg lⅡ

  (Gp:) GGATCC CCTAGG

  (Gp:) AGATCT TCTAGA

  (Gp:) G CCTAG

  (Gp:) GATCC G

  +

  +

  (Gp:) A TCTAG

  (Gp:) GATCT A

  48张

  标题: (三)目的基因

  正文: cDNA (complementary DNA) 基因组DNA (genomic DNA)

  49张

  (四)基因载体

  定义 为携带目的基因,实现其无性繁殖或表达有意义的蛋白质所采用的一些DNA分子。

  常用载体 质粒DNA 噬菌体DNA 病毒DNA

  50张

  克隆载体(cloning vector) 为使插入的外源DNA序列被扩增而特意设计的载体称为克隆载体。 表达载体(expression vector) 为使插入的外源DNA序列可转录翻译成多肽链而特意设计的载体称为表达载体。

  51张

  载体的选择标准

  正文: 能自主复制; 具有两个以上的遗传标记物,便于重组体的筛选和鉴定; 有克隆位点(外源DNA插入点),常具有多个单一酶切位点,称为多克隆位点; 分子量小,以容纳较大的外源DNA。

  52张

  1. 质粒 (plasmid)

  特点 能在宿主细胞内独立自主复制;带有某些遗传信息, 会赋予宿主细胞一些遗传性状。

  53张

  54张

  55张

  λ噬菌体DNA改造系统 λgt系列(插入型,适用cDNA克隆) EMBL系列(置换型,适用基因组克隆)

  2. 噬菌体(phage)

  M13噬菌体DNA改造系统(含lacZ基因) M13mp系列 pUC系列

  56张

  3. 粘性质粒(cosmid)

  57张

  酵母人工染色体 (yeast artificial chromosome, YAC) 细菌人工染色体 (bacterial artificial chromosome, BAC) 动物病毒DNA改造的载体 (如腺病毒,腺病毒相关病毒,逆转录病毒)

  其他

  58张

  59张

  二、基因工程基本原理

  (Gp:) 基本原理

  (Gp:) 目的基因的获取

  (Gp:) DNA导入受体菌

  (Gp:) 外源基因与载体的连接

  (Gp:) 克隆载体的选择和构建

  (Gp:) 重组体的筛选

  (Gp:) 克隆基因的表达

  60张

  以 质 粒 为 载 体 的 DNA 克 隆 过 程

  61张

  标题: (一)目的基因的获取

  正文: 1. 化学合成法 要求:已知目的基因的核苷酸序列或其产物的氨基酸序列 。 2.基因组DNA文库(genomic DNA library) 3. cDNA文库(cDNA library) 4. 聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR) (见第22章)

  62张

  * 化学合成法获取目的基因

  由已知氨基酸序列推测可能的DNA序列

  63张

  组织或细胞染色体DNA

  基因片断

  克隆载体

  重组DNA分子

  含重组分子的转化菌

  限制性内切酶

  受体菌

  基因组DNA文库 存在于转化细胞内由克隆载体所携带的所有基因组DNA的集合

  * 从基因组DNA文库获取目的基因

  64张

  (Gp:) 限制酶切位点

  (Gp:) 限制酶消化

  (Gp:) 除去中间片段

  (Gp:) cos L

  (Gp:) R cos

  (Gp:) cos L 左臂

  (Gp:) R cos 右臂

  (Gp:) 真核生物染 色体DNA

  (Gp:) 限制酶部分消化

  (Gp:) 外源DNA与载体DNA混合

  (Gp:) 连接反应

  (Gp:) 体外包装

  (Gp:) 用重组噬菌体 感染大肠杆菌

  (Gp:) ~20 Kb DNA 片段

  (Gp:) cos L

  (Gp:) R cos

  (Gp:) ~20 Kb 外源 DNA 片段

  (Gp:) 基因文库

  65张

  (Gp:) mRNA

  (Gp:) cDNA

  (Gp:) 双链cDNA

  (Gp:) 重组DNA分子

  (Gp:) cDNA文库

  (Gp:) 反转录酶

  (Gp:) 载体

  (Gp:) 受体菌

  (Gp:) 复制

  (Gp:) * 从cDNA文库获取目的基因

  (Gp:) 逆转录酶

  (Gp:) A A A A

  (Gp:) T T T T

  (Gp:) AAAA

  (Gp:) SI核酸酶

  (Gp:) DNA聚合酶Ⅰ

  (Gp:) 碱水解

  (Gp:) T T T T

  66张

  (三)外源基因与载体的连接

  1. 粘性末端连接 方式:(1)同一限制酶切位点连接 (2)不同限制酶切位点连接 配伍末端连接 非配伍末端连接

  (二)克隆载体的选择和构建

  67张

  Bam HⅠ切割反应

  (Gp:) GGATCC CCTAGG

  T4 DNA连接酶 15oC

  (Gp:) GATCC G

  (Gp:) G CCTAG

  (Gp:) +

  (Gp:) 目的基因用 Bam HⅠ切割

  (Gp:) 载体DNA用Bam HⅠ切割

  (Gp:) 重组体

  (Gp:) 载体自连

  (Gp:) 目的基因自连

  同一限制酶切位点连接

  68张

  不同限制酶切位点(非配伍末端)的连接

  Eco RⅠ切割位点

  Bg lⅡ切割位点

  (Gp:) +

  (Gp:) EcoRⅠ+ Bg lⅡ 双酶切

  (Gp:) Eco RⅠ+ Bg lⅡ 双酶切

  (Gp:) T4 DNA连接酶 15oC

  (Gp:) 重组体

  配伍末端的连接情况和同一限制酶切位点连接相似。

  69张

  2. 平端连接 适用于:限制性内切酶切割产生的平端 粘端补齐或切平形成的平端

  70张

  (Gp:) 目的基因

  (Gp:) 载体

  (Gp:) 限制性内切酶

  (Gp:) 限制性内切酶

  (Gp:) T4 DNA连接酶 15oC

  (Gp:) 重组体

  (Gp:) 载体自连

  (Gp:) 目的基因 自连

  71张

  3. 同聚物加尾连接 在末端转移酶(terminal transferase)的作用下,在DNA片段末端加上同聚物序列、制造出粘性末端,再进行粘端连接。

  72张

  (Gp:) 5′ 3′

  (Gp:) 3′ 5′

  载体DNA

  (Gp:) 5′ 3′

  (Gp:) 3′ 5′

  目的基因

  限制酶或机械剪切

  限制酶

  (Gp:) 5′ 3′

  (Gp:) 3′ 5′

  (Gp:) 5′ 3′ T(T)nT

  (Gp:) T(T)nT 3′ 5′

  (Gp:) 5′ 3′

  (Gp:) 3′ 5′

  (Gp:) 5′ 3′ A(A)nA

  (Gp:) A(A)nA 3′ 5′

  (Gp:) λ-核酸外切酶

  (Gp:) λ-核酸外切酶

  (Gp:) 末端转移酶 + dATP

  (Gp:) 末端转移酶 + dTTP

  (Gp:) T(T)nT A(A)nA

  (Gp:) A(A)nA T(T)nT

  (Gp:) T4 DNA连接酶 15oC

  (Gp:) 重组体

  73张

  4. 人工接头(linker)连接 由平端加上新的酶切位点,再用限制酶切除产生粘性末端,而进行粘端连接。

  74张

  人工接头及其应用

  (Gp:) CCGAATTCG GGCTTAAGC

  (Gp:) 5′- 3′-

  (Gp:) Eco RⅠ

  (Gp:) Eco RⅠ

  (Gp:) Eco RⅠ

  (Gp:) Eco RⅠ

  75张

  受体菌条件 安全宿主菌 限制酶和重组酶缺陷 处于感受态(competent)

  导入方式 转化 (transformation) 转染 (transfection) 感染 (infection)

  (四)重组DNA导入受体菌

  76张

  (五)重组体的筛选 1. 直接选择法 (1) 抗药性标记选择 (2) 标志补救(marker rescue) (3) 分子杂交法 原位杂交 Southern印迹 2. 免疫学方法 如免疫化学方法及酶免检测分析等

  77张

  (插入失活法) 抗药性标记选择

  78张

  组氨酸缺陷 型大肠杆菌

  无组氨酸 的培养基

  酵母咪唑甘油磷 酸脱水酶基因

  促进组氨酸合成

  λDNA

  重组体

  标志补救

  79张

  α互补

  80张

  α 互补的检测

  81张

  原位杂交

  82张

  Southern印迹

  83张

  基因工程操作过程可形象归纳为

  小 结

  (Gp:) 分

  (Gp:) 分离目的基因

  (Gp:) 切

  (Gp:) 限制酶切目的基因与载体

  (Gp:) 接

  (Gp:) 拼接重组体

  (Gp:) 转

  (Gp:) 转入受体菌

  (Gp:) 筛

  (Gp:) 筛选重组体

  84张

  基因工程操作的主要步骤

  (Gp:) 载体

  (Gp:) 质粒

  (Gp:) 噬菌体

  (Gp:) 病毒

  (Gp:) 目的基因(外源基因)

  (Gp:) 基因组DNA

  (Gp:) cDNA

  (Gp:) 人工合成

  (Gp:) PCR产物

  (Gp:) 限制酶消化

  (Gp:) 开环载体DNA

  (Gp:) 目的基因

  (Gp:) 连接酶

  (Gp:) 重组体

  (Gp:) 转化

  (Gp:) 体外包装,转染

  (Gp:) 带重组体的宿主

  (Gp:) 筛选

  (Gp:) 表型筛选

  (Gp:) 酶切电泳鉴定

  (Gp:) 菌落原位杂交

  85张

  表达体系的建立 表达载体的构建 受体细胞的建立 表达产物的分离纯化

  (六)克隆基因的表达

  86张

  1. 原核表达体系 (E.coli表达体系最为常用) 标准:选择标志 强启动子 翻译调控序列 多接头克隆位点 E.coli表达体系的不足 不宜表达真核基因组DNA 不能加工表达的真核蛋白质 表达的蛋白质常形成不溶性包涵体 (inclusion body) 很难表达大量可溶性蛋白

  87张

  大鼠胰岛素原cDNA 的表达和分泌

  88张

  89张

  优点:可表达克隆的cDNA及真核基因组DNA 可适当修饰表达的蛋白质 表达产物分区域积累 缺点:操作技术难、费时、经济

  转染 —— 将表达载体导入真核细胞的过程

  方法:磷酸钙转染 DEAE葡聚糖介导转染 电穿孔 脂质体转染 显微注射

  2. 真核表达体系 酵母、昆虫、乳类动物细胞

  90张

  表达载体pFASTBACI 的物理图谱

  91张

  92张

  93张

  (一)疾病基因的发现与克隆 根据基因定位克隆之并研究其性质,而认识疾病的分子机制。

  标题: 三、与医学的关系

  (二)生物制药

  94张

  医药产品

  95张

  基因诊断(genetic diagnosis)是利用分子生物学及分子遗传的技术和原理,在DNA水平分析、鉴定遗传疾病所涉及基因的置换、缺失或插入等突变。

  标题: (三)基因诊断

  基本过程

  区分或鉴定DNA的异常

  分离、扩增待测的DNA片断

  96张

  标准 . 能正确扩增靶基因; . 能准确区分单个碱基的差别; . 本底或噪声低,不干扰DNA的鉴定; . 便于完全自动化操作,适合大面积、大人群普查。

  97张

  (四)基因治疗

  定义 基因治疗(gene therapy)是向有功能缺陷的细胞补充相应功能的基因,以纠正或补偿其基因的缺陷,从而达到治疗的目的。

  方式 体细胞基因治疗 (somatic cell gene therapy) 性细胞基因治疗 (germ line gene therapy)

  98张

  1. 产前诊断 2. 携带者测试 3. 症候前诊断 4. 遗传病易感性

  (五)遗传疾病的预防

  99张

  100张

  正文: Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat(规律成簇的间隔短回文重复) Cas9是一种蛋白质,可以识别在CRISPR中存储的特殊序列,并通过序列匹配剪切所有的DNA。 传统的CRISPR组件包括基础版酿脓链球菌Cas9酶(SpCas9)、引导RNA(gRNA)

  CRISPR-Cas9

  101张

  102张

  103张

  正文: CRISPR并不是第一个允许我们在各种生物体中编辑DNA的技术工具。其他广泛使用的技术包括TALEN和zinc-finger nucleases (ZFNs)等。 CRISPR比其他技术有一个重要的优势,即它使用起来更加容易,也更快。以前的大多数技术都需要从头开始创建分子,以便在特定的DNA序列中做出改变。在CRISPR中,同样的Cas9分子可以通过简单合成,提供一个向导RNA(guide RNA)分子来靶向到任何序列。

  104张

  正文: 从理论上讲,CRISPR可以用来修改几乎所有生物的DNA,以适应各种不同的应用。

  105张

  标题: 体外基因编辑

  正文: 其步骤包括提取人体细胞,在实验室进行改造,并将它们重新注回患者体内。

  106张

  标题: 体内基因编辑

  正文: 是利用载体将CRISPR-Cas9送到患者体内,直接从细胞内编辑DNA。CRISPR可以通过纳米粒子等载体完成传递或编码成DNA,一旦完成任务,就可以被清除出体外。

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  正文: SpCas9蛋白由1,368个氨基酸组成,体积太大不能通过病毒包装和递送。对此,科学家们希望设计出更精简版的Cas9。 最小化的MISER Cas9突变体仅仅只包含880个氨基酸,约为原始SpCas9大小的三分之二。

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  正文: 一些突变的Cas9s可以锁定基因组中的特定靶点,但是并不能切断DNA。 但是,这个功能缺陷的Cas9s同样也是一个方便的工具,可以运送其他分子到达特定的目的地。一个特别强大的CRISPR技术——“碱基编辑”(base editing)则是利用该工具将一种关键酶运送至特定碱基,随后实现单碱基的置换。

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  正文: 已知的许多遗传疾病由点突变引起,将胞嘧啶脱氨酶与CRISPR/Cas9进行融合,在gRNA的指导下,不引起DNA双链断裂,直接实现胞嘧啶(C)到尿嘧啶(U)的转变,而DNA复制进一步使得U被T代替,从而实现C→T (or G→A)的转换。 将编码tRNA腺嘌呤脱氨酶(TadA) 与CRISPR/Cas9系统融合,在不引起DNA链断裂的情况下实现了A?T到G?C的转换,这样就实现了C?G到T?A和A?T到G?C的高效编辑,为多种遗传疾病的治疗提供了有效工具。

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